2020年全市共有各类卫生机构2043个(含农村卫生站及村级医疗点),其中医院、卫生院162个,专科疾病防治机构7个,妇幼保健院7个,疾病预防控制中心6个,卫生监督检验机构6个。各类卫生机构拥有床位18643张,比上年增长8.0%;其中医院、卫生院床位15953张,增长9.7%。各类卫生技术人员19991人,增长4.9%;其中执业医师4473人,增长4.1%;执业助理医师2108人,下降8.2%;注册护士8995人,增长6.8%。全市已建立农村卫生站及村级医疗点1518个。全年无偿献血25022人次,献血量808.80万毫升。
2020年全市农村清洁卫生水普及率达100%;农村自来水普及率达93.15%,农村卫生厕所普及率达99.08%。
深河人民医院项目由深圳全额帮扶建设,拟建设成为现代化三级综合医院。2019年12月6日,深河人民医院主体结构正式封顶。2020年11月,河源市入选国家医疗保障局区域点数法总额预算和按病种分值付费试点城市名。